到了清朝，统治者同样将白莲教视为“异端”，其禁止程度比明朝有过之而无不及。但就是在这种严厉禁止的政策下，偏偏在嘉庆年间，爆发了一场由白莲教徒领导的、历时九年的一场大起义。
18世纪末的清朝，社会矛盾日益激化，蛰伏已久的白莲教徒们抓住矛盾，到处宣传清王朝快要灭亡了，将来会出现新的世界，入教的人都可以分到土地等等白莲教的教义。受够地主剥削的贫苦农民，都渴望得到土地，纷纷参加了白莲教。
参加白莲教的人越来越多，终于惊动了皇帝，于是清廷命令各省宫府捉拿教徒。
一些地方官吏本来就是敲诈勒索的老手，趁机派出差役挨家挨户地查问，不管你是不是教徒，都得拿出钱来“孝敬”他们。有钱的出钱买命，没钱的穷人就被抓到监狱里拷打，直至送命。
此时的白莲教首领刘之协于是在襄阳召集教徒开会，决定用“官逼民反”的口号，发动群众起义，并且派出教徒分头到各地去联合。
湖北郧阳地区地处三省交界，官府鞭长莫及，是清朝统治的薄弱的环节。因此这里也是白莲教活动比较活跃的地区，有着广泛的群众基础。再加上这里层峦叠嶂，山高林密，刘之协决定在这里发动起义。
嘉庆元年(1796年)正月，白莲教徒张正谟、聂杰人率先发动起义，起义军分别以青、黄、蓝、白、绿五色为号，又没置掌柜、主巾、先锋、总兵诸名目，还明确宣布了“戒贪、戒杀、戒淫”的军纪，所到之处秋毫无犯，一时军威大辰。
1796年秋，起义军攻入陨西县城，捣毁县衙，打开监狱，砸烂刑具，并在县衙前召开大会，开仓济贫。
与此同时，湖北襄阳的白莲教首领齐林等人，也正在加紧准备，准备在元宵节那天发动起义。不料起义还没开始，教中出了叛徒，齐林等人被清廷抓捕杀害了。
齐林死后，其妻王聪儿接过起义的大旗，率领白莲教徒发动起义。义军在郧阳山区转战半年后，来到四川与四川的白莲教首领姚之富率领的赵紫义军会师，起义队伍也发展到了十万余人。
王聪儿虽然是女性，但英勇善战，爱护官兵，威信很高，被大家推为起义军的首领。清廷派了数万清军赶来围剿，想在川东地区将起义军消灭。
为了粉碎清廷的“围剿”计划，王聪儿指挥义军强渡汉水，发动了着名汉中大战，顺利进入陕西。
气急败坏的嘉庆帝下令从全国各地抽调大军，集中兵力围剿王聪儿。清军将领明亮向嘉庆帝建议各地地方组织民团，修筑碉堡，起义军一来，就把老百姓赶到碉堡里去，让起义军得不到粮草供应，是为“坚壁清野”之计。
清军采取这种策略后，起义军活动越来越困难。王聪儿只得亲自率领两万人马攻打西安，想攻下西安后取得补给。但清军早就在西安布下重兵，起义军在西安遭受了严重的损失，不得不退回湖北。
在王聪儿的起义军朝湖北撤退时，清军尾随不放，终于在郧西县三岔河追上了王聪儿。起义军与清军激战几天几夜后，终因寡不敌众，大部分战死，其余少数人随王聪儿退到附近的山中。
1798年4月21日，王聪儿组织剩余的数百义军突围，但清军的包围圈十分紧密，根本无法突围出去。王聪儿见突围不成，于是纵身从悬崖跳了下去，壮烈牺牲。
王聪儿牺牲后，郧阳地区流传着不少有关她的传说。在民间故事中，老百姓传说王聪儿跳崖后并没有死，而是被弥勒佛超渡成仙了。
经过九年的战斗，这场爆发于清代嘉庆年间的白莲教起义终于失败了。但这场起义也动摇了清朝统治的基础，以这场起义为转折点，清朝开始由盛世走向衰落。
起义失败后，不少幸存下来的白莲教徒继续在民间秘密传教，经过数十年的发展，后来横行淮北地区的“捻军”中，便有不少是当年白莲教众的徒弟和后人。
从宋朝建立到清朝后期，白莲教在民间一直不乏信徒。它究竟有什么魅力，能吸引广大老百姓？
白莲教是一个很好地利用了佛教、弥勒教等教派的教义，并将其转换为能为老百姓接受的朴素的道理，所以才有了源源不断的信徒。
比如它提倡念佛持戒，规定不杀生、不偷盗、不邪淫、不妄语、不饮酒，号召信徒敬奉祖先，都符合中国人的传统。同时它又宣称弥勒佛一定会降生，光明最后一定会战胜黑暗，又给了底层人民最大的信心和憧憬，所以很多老百姓愿意信它。
只有新国家成立后，人民当家做了主人，不再有剥削和被剥削之后，“白莲教”这才渐渐湮灭在了历史深处。
所以白莲教就是一个有文化、有背景、有武器的独立武装政权啊！
一旦让白莲教得势，联合大明朝官员的乱臣贼子，后果不堪设想。
所以马政想到了千古第一阳谋，招安，然后一网打尽！
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